Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc18Q8VD24 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc18Q8VD24 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc18Q8VD24 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc18Q8VD24 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms