Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc9Q8VC31 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc9Q8VC31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms