Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nae1Q8VBW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nae1Q8VBW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nae1Q8VBW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms