Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SdsQ8VBT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SdsQ8VBT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SdsQ8VBT2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms