Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnaaf4Q8R368 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnaaf4Q8R368 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnaaf4Q8R368 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dnaaf4Q8R368 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnaaf4Q8R368 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms