Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc12Q8R344 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc12Q8R344 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms