Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gle1Q8R322 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gle1Q8R322 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gle1Q8R322 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms