Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Matr3Q8K310 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Matr3Q8K310 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matr3Q8K310 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms