Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsl1Q8K305 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsl1Q8K305 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms