Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccm2Q8K2Y9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccm2Q8K2Y9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms