Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fcho1Q8K285 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fcho1Q8K285 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcho1Q8K285 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms