Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300eQ8K249 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd300eQ8K249 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd300eQ8K249 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms