Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T0

Tmprss3, Transmembrane protease serine 3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss3Q8K1T0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmprss3Q8K1T0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss3Q8K1T0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmprss3Q8K1T0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms