Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog3Q8CI04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog3Q8CI04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog3Q8CI04 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms