Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY7

Ttc23, Tetratricopeptide repeat protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23Q8CHY7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc23Q8CHY7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc23Q8CHY7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc23Q8CHY7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms