Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Parp11Q8CFF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp11Q8CFF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp11Q8CFF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp11Q8CFF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms