Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf17Q8CFA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf17Q8CFA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf17Q8CFA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms