Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms