Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bola3Q8CEI1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bola3Q8CEI1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bola3Q8CEI1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bola3Q8CEI1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms