Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc17Q8CE13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc17Q8CE13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc17Q8CE13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms