Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrrn3Q8CBC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn3Q8CBC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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