Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930572O03RikQ8C5Y0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930572O03RikQ8C5Y0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930572O03RikQ8C5Y0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930572O03RikQ8C5Y0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930572O03RikQ8C5Y0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930572O03RikQ8C5Y0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms