Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csgalnact2Q8C1F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Csgalnact2Q8C1F4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms