Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TiparpQ8C1B2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TiparpQ8C1B2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TiparpQ8C1B2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms