Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q3

Ttc34, Tetratricopeptide repeat protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc34Q8C0Q3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc34Q8C0Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc34Q8C0Q3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc34Q8C0Q3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc34Q8C0Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms