Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx22Q8C084 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx22Q8C084 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms