Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap20Q8BTU1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap20Q8BTU1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 641.6 ms