Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cep55Q8BT07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep55Q8BT07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep55Q8BT07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep55Q8BT07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep55Q8BT07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms