Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip4Q8BQP8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip4Q8BQP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms