Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,73□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,71□□□□□ -0,05
5730596B20RikQ8BQ08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14,69□□□□□ -0,06
5730596B20RikQ8BQ08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14,69□□□□□ -0,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,7 ms