Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efemp1Q8BPB5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Efemp1Q8BPB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efemp1Q8BPB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms