Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan12Q8BKT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan12Q8BKT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms