Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop53Q8BK35 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop53Q8BK35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop53Q8BK35 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms