Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcal1Q8BJL0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms