Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo28Q8BIG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo28Q8BIG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo28Q8BIG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo28Q8BIG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo28Q8BIG4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo28Q8BIG4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo28Q8BIG4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo28Q8BIG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms