Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco3Q8BH01 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco3Q8BH01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco3Q8BH01 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco3Q8BH01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmco3Q8BH01 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco3Q8BH01 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms