Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW8

Vgll2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll2Q8BGW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll2Q8BGW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vgll2Q8BGW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vgll2Q8BGW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vgll2Q8BGW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vgll2Q8BGW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms