Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best2Q8BGM5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best2Q8BGM5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Best2Q8BGM5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms