Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc17a8Q8BFU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc17a8Q8BFU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc17a8Q8BFU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms