Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpped1Q8BFS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cpped1Q8BFS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpped1Q8BFS6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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