Protein–RNA interactions for Protein: Q811G0

Bbs9, Protein PTHB1, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs9Q811G0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bbs9Q811G0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bbs9Q811G0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbs9Q811G0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbs9Q811G0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbs9Q811G0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms