Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc2Q80W04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmcc2Q80W04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmcc2Q80W04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms