Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT37

Elp1, Elongator complex protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp1Q7TT37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Elp1Q7TT37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Elp1Q7TT37 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Elp1Q7TT37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Elp1Q7TT37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms