Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp3Q7TST5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lamp3Q7TST5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lamp3Q7TST5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms