Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClmQ7TSN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms