Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdp1Q7TSG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdp1Q7TSG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdp1Q7TSG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdp1Q7TSG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms