Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmc3Q7TQ69 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmc3Q7TQ69 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmc3Q7TQ69 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc3Q7TQ69 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms