Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ48

Srl, Sarcalumenin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrlQ7TQ48 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrlQ7TQ48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrlQ7TQ48 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrlQ7TQ48 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrlQ7TQ48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms