Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ShprhQ7TPQ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ShprhQ7TPQ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ShprhQ7TPQ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ShprhQ7TPQ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ShprhQ7TPQ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms