Protein–RNA interactions for Protein: Q717B4

Tdpoz3, TD and POZ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz3Q717B4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdpoz3Q717B4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdpoz3Q717B4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdpoz3Q717B4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdpoz3Q717B4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms